Problematyka funkcjonowania powstałego na nowo w Polsce rynku kapitałowego początkowo umiejscowiona była w Katedrze Finansów. Wraz z rozwojem rynku zaistniała konieczność szerszego ujęcia tej problematyki w procesie dydaktycznym, a także podjęcia badań naukowych. Do realizacji tych zadań w dniu 1 kwietnia 1998 roku w ramach Katedry Finansów powołany został Zakład Rynku Kapitałowego. Po podzieleniu się Katedry Finansów, z dniem 1 lutego 2001 roku została utworzona Katedra Rynku Kapitałowego. Dalszy rozwój rynków finansowych i wzrost ich znaczenia w gospodarce, szerszy zakres prowadzonych badań oraz rozszerzenie oferty dydaktycznej dla studentów wszystkich form (nowe specjalności prowadzone przez Katedrę) spowodowały kolejne zmiany. W grudniu 2006 roku Katedra Rynku Kapitałowego zmieniła nazwę na Katedrę Rynków Finansowych. Następnie we wrześniu 2007 roku w ramach Katedry Rynków Finansowych wyodrębnione zostały dwa zakłady: Zakład Rynku Kapitałowego oraz Zakład Inżynierii Finansowej. Kierownikiem Katedry od momentu jej powstania jest Prof. dr hab. Jan Czekaj.
Obecnie w Katedrze Rynków Finansowych zatrudnionych jest 10-ciu pracowników.
Pracownicy Katedry zajmują się prowadzeniem badań nad zagadnieniami rynków finansowych i rynków inwestycji alternatywnych.
W szczególności obszary badawcze obejmują: makroekonomiczne uwarunkowania rynków finansowych, efektywność informacyjną rynków finansowych, finanse behawioralne, mikrostrukturalne aspekty rynków finansowych, zastosowanie metod ilościowych w modelowaniu zjawisk zachodzących na rynkach finansowych, zagadnienia dużych zbiorów danych w zastosowaniu do rynków finansowych, inwestycje alternatywne na rynkach energii i wina, aspekty podatkowe inwestycji, fundusze inwestycyjne i hedgingowe.
